- горькие гликозиды абсинтин и анабсинтин, обладающие стимулирующим пищеварение,
- противовоспалительным и противоязвенным действием,
- эфирное масло, проявляющее бактерицидное и фунгицидное действие;
- дубильные, слизистые и смолистые вещества;
- каротин;
- витамины С, К и другие соединения.
Японские исследователи относят капиллин, выделенный из полыни, к активным антибиотикам. Содержащиеся в растении терпеноидные соединения оказывают выраженный противовоспалительный эффект.
Полынь обыкновенную используют в качестве средства, улучшающего процессы пищеварения за счёт стимуляции нейрорецепторов слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта, возбуждения аппетита, стимуляции функции пищеварительных желёз, секреции желчи и панкреатического сока, а также как лёгкое снотворное, седативное, ветрогонное средство.
При бронхитах, пневмонии применяют как потогонное и противокашлевое средство Врач-натуропат из США Гилда Кларк широко применяла полынь в программах дегельминтизации и отмечала, что экстракт травы полыни горькой оказывает противопаразитарное действие широкого спектра, особенно в отношении круглых гельминтов (аскариды, острицы и т. д.).